《铁血大旗》以边陲铁血大旗门和中原五福联盟的仇恨为主线。以大旗门用五马分屍的酷刑处决爱上仇家寒风堡堡主的大女儿的大弟子云铿来渲染一种悲壮的气氛，同时也突出了铁血大旗门的“铁血”二字。冲动的三弟子云铮怨恨父亲即大旗门掌门云翼的无情，在行刑过后，想独自找回大哥的尸身。不料被寒风堡的人包围。二弟子铁中棠制住寒风堡堡主的小女儿冷青萍，以此要挟寒风堡放人，但是心高气傲的云铮却拒不领情。这时五福联盟的另外三家赶到，连累铁中棠卷入战场。落日牧场场主司徒笑欲放长线钓大鱼，故意放走二人。在回驻地的途中，铁中棠担心是欲擒故纵之计，劝云铮暂先不回驻地。云铮恼恨铁中棠行刑杀害云铿，故意不听他的话，迳自回到驻地。云翼发现其中有诈，重责云铮和铁中棠，欲将二人逐出大旗门，掌刑人云九霄不忍二人前程就此断送，也想为本就人丁稀薄的大旗门保留两个优秀的青年，修改掌门号令，从轻判决将其二人逐出师门三年。宣布行刑之后，大旗门其他人先行撤退，准备三年后再来复仇。铁中棠与云铮决定留下抵挡一阵，争取大旗门撤退的时间。争斗中，云铮冲动的性格令自己受伤，铁中棠历尽千辛万苦将云铮救出，自己身受重伤，险些送命。在逃命途中，云铮对铁中棠的误会进一步加深。铁中棠在只能逃走一人的情况下选择了让云铮走。云铮走后，铁中棠的机智和运气也令自己死里逃生。从此，师兄弟二人各自开始自己的奇遇之旅。